Le FFS comprendono tre Divisioni, la società del Gruppo FFS Cargo e dieci Settori centrali con funzioni di pilotaggio e di servizio. Le Divisioni e la società del Gruppo hanno il compito di gestire e sviluppare la propria attività operativa. Queste sono:

• Viaggiatori
• Infrastruttura
• Immobili
• Società del Gruppo: FFS Cargo SA

Altri dieci Settori centrali sono deputati alla direzione e alla gestione unitaria delle FFS e sostengono le attività operative con funzioni di servizio e supporto. I Settori centrali sono:

• Finanze
• Human Resources
• Informatica
• Comunicazione
• Public Affairs e regolamentazione
• Sviluppo dell’azienda
• Sicurezza e produzione
• Clienti
• Diritto e compliance
• Supply Chain Management