Bauen ist jedoch leider unvermeidbar mit Emissionen verbunden. Es wird für die Anwohnenden Baulärm in unterschiedlicher Intensität über die gesamte Bauzeit geben, auch in der Nacht und an Wochenenden. Die SBB und die Bauunternehmungen sind sich bewusst, dass dies für die Anwohnenden störend sein kann. Sie sind darauf bedacht, unvermeidbar lärmintensive Arbeiten tagsüber durchzuführen. Die SBB wird ihr Möglichstes tun, die Emissionen aufs geringste zu reduzieren und wenn möglich Bahntransporte vorsehen. Auf Erfahrungen von ähnlichen und nahgelegenen Bauprojekten wie etwa «Zukunft Bahnhof Bern» oder «Entflechtung Wylerfeld» wird dabei zurückgegriffen.

Bevor die Reisenden vom Angebotsausbau und den Verbesserungen im Bahnzugang profitieren, werden sie die Bauarbeiten intensiv spüren. Es ist während der gesamten Bauzeit mit Einschränkungen im Bahnzugang sowie Änderungen im Fahrplan zu rechnen.